本教材包括两个部分：第一部分（1～6章），介绍数学模型建模的基本理论和方法，计算机仿真的基本理论和方法，以及建模与仿真的校核、验证和确认（VVA）技术；第二部分（7～10章），分别介绍生物系统建模仿真的四类典型范例。在第一部分中，第1章概述系统、系统建模及计算机仿真的基本概念，以及生物系统建模仿真的应用动态概况；第2章介绍连续系统数学模型的类型、模型之间的相互转换以及模型的建模方法等；第3章介绍连续时间数学模型转换为计算机仿真模型的主要方法： 数值积分法、离散相似法和替代法；第4章介绍基于实验数据的建模仿真的基本理论与方法，包括参数模型的概念及模型参数估计方法，以及系统辨识的基本概念和方法；第5章介绍在MATLAB平台上Simulink模块式建模仿真的基本理论和方法，以及Simulink建模仿真的典型例子；第6章介绍建模与仿真的校核、验证和确认（VVA）技术的基本概念。在第一部分的基础上，第7~10章分别介绍生物系统建模和仿真的4个典型实例。第7章是单一种群增长的微分方程模型，包括Malthusian方程和Logistic方程；第8章介绍房室模型的建模与仿真，以及房室模型的辨识和可辨识性；第9章介绍描述动作电位产生的HodgkinHuxley方程的建模与仿真；第10章介绍脑电的自回归（AR）模型的建模与仿真。本教材为普通高等院校生物医学工程专业本科生教材，也可作为相关专业本科生和研究生的参考教材，并可供从事生物建模仿真的科技工作人员参考。