本书运用马克思的生产力和生产关系理论、马克思的劳动价值论与科技劳动思想、熊彼特的创新经济发展理论、新经济增长理论、诺思制度变迁与经济增长理论、福利经济学和凯恩斯主义关于政府干预的思想、国家创新系统理论等理论和思想对中国经济高质量发展与创新系统进行研究。首先，对创新系统进行解构，把创新系统分为创新主体、创新方式和创新能力三个要素，深入研究和揭示创新系统的运行机制及其规律；其次，从对经济高质量发展的理性认识和客观要求出发，试图在理论上阐释中国经济高质量发展与创新系统的内在关联；在此基础上，以“长时段的历史观”对中国经济高质量发展与创新系统的历史与现实进行了事实描述，并据此就创新系统对经济高质量的作用效果进行实证研究，基于实证结论，发现和提出发展过程中可能存在的问题；最后，以开放的大视野聚焦国外创新系统促进经济发展质量提升的实践，以提炼和总结出对我国创新系统优化与经济高质量发展实现的重要启示，并提出中国经济高质量发展与创新系统进一步优化的政策建议。