人体共生微生物已被证实与多种复杂疾病有关，对共生菌群的研究，不仅可以规范个人健康管理，也能为公共卫生政策的制定提供指导。本书主要围绕人体共生微生物的致病机理，讲述从出生到衰老的各个阶段，人体各部位（肠道，口腔/呼吸道，皮肤及生殖道）的共生微生物如何随着环境、饮食、免疫反应等发生改变。书中介绍了微生物中包含了哪些对预测疾病风险有帮助的信息，讨论了随着高通量测序的成熟，微生物关联分析实验的设计原则，例如微生态，因果推断等。每章配有开放性的思考题，用来启发读者结合自身领域，思考宏基因组学潜在的应用场景。